Данные центры предназначены для оказания медицинской помощи (в круглосуточном режиме) больным в плановой, неотложной и экстренной формах. А именно: профилактика, диагностика и лечение заболеваний, медицинская реабилитация, военно-врачебная экспертиза и медицинское освидетельствование военнослужащих.
Подразделения медицинских центров, осуществляющие приём и лечение пациентов различного профиля, функционально и территориально разделены. Для приёма и лечения больных центры располагают комплексом диагностических лечебных и вспомогательных подразделений.